Según lo dispuesto por el artículo 10 de la ley 715 de 2001, además de las funciones señaladas en otras normas, tendrá las siguientes:

• Dirigir la preparación del Proyecto Educativo Institucional con la participación de los distintos actores de la comunidad educativa.
• Presidir el Consejo Directivo, el Consejo Académico, consejo de práctica de la institución y coordinar los distintos órganos del Gobierno Escolar.
• Representar el establecimiento ante las autoridades educativas y la comunidad escolar.
• Formular planes anuales de acción y de mejoramiento de calidad, y dirigir su ejecución.
• Dirigir el trabajo de los equipos docentes y establecer contactos interinstitucionales para el logro de las metas educativas.
• Realizar el control sobre el cumplimiento de las funciones correspondientes al personal docente y administrativo y reportar las novedades e irregularidades del personal a la secretaría de educación departamental o quien haga sus veces.
• Administrar el personal asignado a la institución en lo relacionado con las novedades y los permisos.
• Participar en la definición de perfiles para la selección del personal docente, y en su selección definitiva.
• Distribuir las asignaciones académicas, y demás funciones de docentes, directivos docentes y administrativos a su cargo, de conformidad con las normas sobre la materia.
• Realizar la evaluación anual del desempeño de los docentes, directivos docentes y administrativos a su cargo.
• Imponer las sanciones disciplinarias propias del sistema de control interno disciplinario de conformidad con las normas vigentes.
• Proponer en asocio con el consejo académico a los docentes que serán apoyados para recibir capacitación.
• Suministrar información oportuna al departamento, distrito o municipio, de acuerdo con sus requerimientos.
• Responder por la calidad de la prestación del servicio en su institución.
• Administrar el Fondo de Servicios Educativos y los recursos que por incentivos se le asignen, en los términos de la presente ley.
• Publicar una vez al semestre en lugares públicos y comunicar por escrito a los padres de familia, los docentes a cargo de cada asignatura, los horarios y la carga docente de cada uno de ellos.
• Las demás que le asigne el gobernador o alcalde para la correcta prestación del servicio educativo.

Como Ordenador del Gasto, según el decreto 4791 del 19 de diciembre de 2008 son responsabilidades del Rector las siguientes:

• Elaborar el proyecto anual de presupuesto de Fondos de Servicios Educativos y presentarlo para aprobación al consejo directivo.
• Elaborar el flujo de caja anual del FSE estimado mes a mes, hacer los ajustes correspondientes y presentar los informes de ejecución por lo menos trimestralmente al consejo directivo
• Celebrar los contratos, suscribir los actos administrativos y ordenar los gastos con cargo a los recursos del FSE de acuerdo con el flujo de caja y el plan operativo de la respectiva vigencia fiscal, previa disponibilidad presupuestal y de tesorería
• Presentar mensualmente el informe de ejecución de los recursos del FSE
• Realizar los reportes de información financiera, económica, social y ambiental, con los requisitos y en los plazos establecidos por los organismos de control y la Contaduría General de la Nación y efectuar la rendición de cuentas con la periodicidad establecida en las normas.
• Suscribir junto con el contador los estados contables y la información financiera requerida y entregarla en los formatos y fechas fijadas para tal fin.
• Presentar al final de cada vigencia fiscal a las autoridades educativas de la respectiva entidad territorial certificada, e informe de ejecución presupuestal incluyendo el excedente de recursos no comprometidos si los hubiere, sin perjuicio de que la entidad pueda solicitarlo en periodicidad diferente
• Presentar al Alcalde, en la periodicidad que éste determine, un informe sobre la ejecución de los recursos que hubiere recibido por parte de la entidad territorial.